Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelenofQ9ERR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelenofQ9ERR7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms