Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Strn3Q9ERG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn3Q9ERG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn3Q9ERG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309.6 ms