Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dap3Q9ER88 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dap3Q9ER88 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dap3Q9ER88 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms