Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chst1Q9EQC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chst1Q9EQC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms