Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufs3Q9DCT2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufs3Q9DCT2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufs3Q9DCT2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms