Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb6Q9DC29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb6Q9DC29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb6Q9DC29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms