Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx6Q9DBY5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx6Q9DBY5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms