Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tm9sf1Q9DBU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tm9sf1Q9DBU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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