Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd2Q9D8U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd2Q9D8U0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd2Q9D8U0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifrd2Q9D8U0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd2Q9D8U0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms