Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8L0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8L0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8L0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8L0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8L0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8L0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8L0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8L0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8L0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms