Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan17Q9D7W4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan17Q9D7W4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms