Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc94Q9D6J3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc94Q9D6J3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc94Q9D6J3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc94Q9D6J3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms