Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3404Q9D506 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3404Q9D506 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms