Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930564D02RikQ9D4S4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms