Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933428M09RikQ9D3X3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933428M09RikQ9D3X3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms