Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pus10Q9D3U0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pus10Q9D3U0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pus10Q9D3U0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus10Q9D3U0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus10Q9D3U0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms