Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaaf1Q9D2H9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaaf1Q9D2H9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf1Q9D2H9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf1Q9D2H9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms