Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Batf3Q9D275 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Batf3Q9D275 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Batf3Q9D275 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Batf3Q9D275 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 414.5 ms