Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chordc1Q9D1P4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chordc1Q9D1P4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chordc1Q9D1P4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms