Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chchd2Q9D1L0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd2Q9D1L0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd2Q9D1L0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms