Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx56Q9D0R4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx56Q9D0R4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx56Q9D0R4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx56Q9D0R4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx56Q9D0R4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx56Q9D0R4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx56Q9D0R4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms