Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx17Q9D0I4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx17Q9D0I4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx17Q9D0I4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms