Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZK6

Anks3, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks3Q9CZK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks3Q9CZK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Anks3Q9CZK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Anks3Q9CZK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Anks3Q9CZK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Anks3Q9CZK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms