Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mgme1Q9CXC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mgme1Q9CXC3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mgme1Q9CXC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.7 ms