Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkrip1Q9CWV6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkrip1Q9CWV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkrip1Q9CWV6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms