Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Atxn3Q9CVD2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atxn3Q9CVD2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atxn3Q9CVD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms