Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1aQ9CU62 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1aQ9CU62 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1aQ9CU62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1aQ9CU62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms