Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRD2

Emc2, ER membrane protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc2Q9CRD2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Emc2Q9CRD2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emc2Q9CRD2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emc2Q9CRD2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Emc2Q9CRD2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms