Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc96Q9CR92 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc96Q9CR92 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc96Q9CR92 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms