Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PpidQ9CR16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpidQ9CR16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms