Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ykt6Q9CQW1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ykt6Q9CQW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms