Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpb2Q9CQI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snrpb2Q9CQI7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snrpb2Q9CQI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpb2Q9CQI7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms