Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nudt21Q9CQF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nudt21Q9CQF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudt21Q9CQF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudt21Q9CQF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms