Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap3bQ9CQE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms