Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC27Q9C0I9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC27Q9C0I9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC27Q9C0I9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms