Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC2Q9C0B9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC2Q9C0B9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms