Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM5Q9C035 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM5Q9C035 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM5Q9C035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms