Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1BQ9BZX4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1BQ9BZX4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms