Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BCO2Q9BYV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCO2Q9BYV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCO2Q9BYV7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms