Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP4-3Q9BYR4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP4-3Q9BYR4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms