Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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