Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SCAPERQ9BY12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SCAPERQ9BY12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SCAPERQ9BY12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SCAPERQ9BY12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SCAPERQ9BY12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SCAPERQ9BY12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms