Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNHG12Q9BXW3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNHG12Q9BXW3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms