Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG6Q9BXT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNG6Q9BXT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNG6Q9BXT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms