Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA9Q9BWV2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPATA9Q9BWV2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms