Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25Q9BV90 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRNP25Q9BV90 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25Q9BV90 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25Q9BV90 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms