Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF649Q9BS31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF649Q9BS31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF649Q9BS31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms