Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HINFPQ9BQA5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HINFPQ9BQA5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HINFPQ9BQA5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HINFPQ9BQA5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms