Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX50Q9BQ39 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX50Q9BQ39 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms