Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPOCK3Q9BQ16 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK3Q9BQ16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK3Q9BQ16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCK3Q9BQ16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms